Существует классификация преступлений по различным признакам. Но в данном случае речь идет о той классификации, которая определяет уровень опасности преступления для общества:
•  Особо тяжкие  (>10 лет лишения свободы);
•  Тяжкие (5-10 лет лишения свободы);
•  Менее тяжкие (2-5 лет лишения свободы);
•  Не представляющие большой общественной опасности (<2 лет лишения свободы).
В «Темнеющую Лилию» попадают преступники, совершившие такое деяние, которое относится к пунктам тяжкие и менее тяжкие преступления. Несовершеннолетние, несущие юридическую ответственность за совершенное особо тяжкое правонарушение, не могут отбывать срок в этой тюрьме.

Лишение свободы назначается несовершеннолетним на срок не свыше 10 лет и отбывается в воспитательных колониях, коей «Темнеющая Лилия» и является. Несовершеннолетним, совершившим преступления в возрасте до 16 лет, лишение свободы назначается на срок не свыше 6 лет.
Наказание в виде лишения свободы несовершеннолетним должно быть вызвано серьезными причинами и возможно лишь за тяжкие и особо тяжкие преступления. Но «Темнеющая Лилия» отказалась принимать преступников, совершивших особо тяжкое преступление, и, доказав своё мнение в специальных органах власти, смогла добиться того, о чем говорила. Но преступников (только тяжкие преступления) было слишком мало, и образовались так называемые «пустующие места» тюрьмы. Чтобы это исправить Чернеева Лилия  на законных основаниях смогла добиться того, чтобы несовершеннолетние, совершившие менее тяжкое деяние, могли отбывать срок наказания именно в этом учреждении. (Пленум Верховного Суда РФ в п. 12 Постановления от 14.02.2000 N 7 "О судебной практике по делам о преступлениях несовершеннолетних" по этому вопросу разъяснил: "Суд вправе принять решение о назначении несовершеннолетнему наказания в виде лишения свободы лишь тогда, когда исправление его невозможно без изоляции от общества, обязательно мотивировав в приговоре принятое решение").

Закон прямо запрещает назначать наказание в виде лишения свободы несовершеннолетнему, впервые совершившему преступление небольшой тяжести, а также лицу, совершившему в возрасте до 16 лет впервые преступление средней тяжести.